Plačiausiai molekulinės biologijos analizėje naudojamas metodas yra DNR pagrįstos polimerazės grandininė reakcija (PGR). Šis metodas naudojamas atliekant mikrobiologinę maisto produktų analizę ir pasižymi dideliu jautrumu.
Polimerazės grandininės reakcijos (PGR) metodas pirmą kartą buvo pristatytas 1985 ir padarė perversmą tyrimuose. Šis analizės metodas nustato genetinių pokyčių kiekį maisto produktuose. Šio metodo pagrindas yra nukleorūgščių amplifikacija tinkamomis sąlygomis. Taikant PGR metodą, galima dirbti su nedideliu DNR kiekiu. Ši metodika suteikia didelį greitį ir tikslumą atliekant laboratorinius tyrimus.
Šiandien patogeniniai maisto produktų kilmės mikroorganizmai sukelia daugiau ligų, mirčių ir ekonominių nuostolių nei anksčiau. Dėl šios priežasties maisto pramonėje reikia bandymo ir analizės metodų, kurie užtikrintų greitesnius ir tikslesnius rezultatus nei įprasti maisto saugos metodai. Molekuliniai biologiniai metodai yra sukurti ir naudojami maisto mikrobiologijoje, atsižvelgiant į pokyčius molekuliniame lauke pastaraisiais metais. Šie metodai tapo būtini siekiant apsaugoti žmonių sveikatą ir būti jautresniems aplinkos sąlygoms.
Mikroorganizmams identifikuoti labiau tinka genotipiniai metodai. Augalų genetinių savybių modifikavimas yra augalo DNR pakeitimo procesas, pavyzdžiui, perduodant tam tikrą geną iš mikroorganizmo.
Tokiu būdu augalui suteikiamos norimos savybės. Pavyzdžiui, auginant sojas, genų perdavimas atliekamas siekiant lengviau kontroliuoti piktžoles nepažeidžiant normalaus šio augalo augimo. Paprastai šie genų pernešimai augalams vyksta ne tik perduodant norimus bruožus, bet perduodant tam tikrą genų grandinę. Molekulinės biologijos analizė atskleidžia, ar augale nebuvo atlikta genetinė modifikacija.
